Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms