Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DEUP1Q05D60 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms