Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4A11Q02928 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms