Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC2Q02487 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms