Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMF1P82094 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms