Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms