Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN12P56749 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms