Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.1 ms