Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA1P56159 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms