Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms