Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACLYP53396 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACLYP53396 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACLYP53396 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACLYP53396 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACLYP53396 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACLYP53396 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACLYP53396 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACLYP53396 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms