Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMSP52788 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMSP52788 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMSP52788 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMSP52788 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMSP52788 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMSP52788 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMSP52788 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMSP52788 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms