Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms