Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms