Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms