Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNTAP49354 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNTAP49354 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNTAP49354 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNTAP49354 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms