Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POU3F4P49335 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms