Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms