Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARGP37231 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPARGP37231 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARGP37231 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms