Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms