Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNA7P36544 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms