Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms