Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFTPDP35247 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms