Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms