Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCGF2P35227 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms