Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPC1P35052 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPC1P35052 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms