Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASQ1P31415 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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CASQ1P31415 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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