Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms