Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms