Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRHP20396 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRHP20396 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRHP20396 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRHP20396 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms