Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCNA2P20248 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms