Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB6P18564 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms