Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR1P18146 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms