Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms