Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms