Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACANP16112 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACANP16112 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACANP16112 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACANP16112 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACANP16112 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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