Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms