Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH1P12830 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH1P12830 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH1P12830 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH1P12830 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms