Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNB1P11230 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms