Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms