Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLK3P07288 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLK3P07288 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms