Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TK1P04183 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TK1P04183 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TK1P04183 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TK1P04183 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms