Protein–RNA interactions for Protein: P00846

MT-ATP6, ATP synthase subunit a, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP6P00846 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MT-ATP6P00846 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MT-ATP6P00846 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms