Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYF2O95926 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms