Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms