Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms