Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP19O94966 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP19O94966 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP19O94966 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP19O94966 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP19O94966 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
USP19O94966 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP19O94966 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP19O94966 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms