Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN11O75508 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms