Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP4O75379 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms