Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms